تم انشاء القسم عام 1970 كوحدة من وحدات امراض الباطنة العامة, و بدأ في حجرة واحدة في المبنى الرئيسي للمشفى الجامعي وكان تحت اشراف اد/ فتحي هندي ( استاذ الامراض الجلدية و التناسلية جامعة الاسكندرية ثم تحت اشراف ا.د/ وهبة احمد حسن ( استاذ الامراض الجلدية و التناسلية جامعة الاسكندرية) ايضا. وتم فصل قسم الامراض الجلدية و التناسلية كقسم مستقل عام 1980 حيث تم نقله الي مبنى العيادة الشاملة وكان حينئذ برئاسة اد/ عبد الله كاطو الذي قام بدوره بانشاء وحدات عديدة بالقسم و توالى رؤساء القسم كلتالي:
1- ا.د/عبد الله كاطو 2- ا.د/ ابوبكر محمد 3- ا.د/ وفاء رمضان 4- ا.د/ عبد الحكم هديب 5- ا.د/ فاطمة عبد الغفار 6- ا.د/ مصطفى حسين 7- ا.د/ ليلى منصور 8-ا.د/ نجوى علوان 9-ا.د/ايمان المعداوى 10-ا.د / السيد هويدى