هو ان يكون واحد من أقسام الميكروبيولوجيا الطبيه والمناعه البارز بالجامعات الوطنية و الاقليمية لتقديم أفضل الجهود فى الابعاد الثلاثة : التعليم – البحث – خدمة المجتمع . ان يكون منافسا قويا فى المدارس الطبية المتقدمه فى مجال الميكروبيولوجى اقليميا و دوليا . ان يكون واحدا من أكبر مراكز تقديم الخدمات المتميزه للتشخيص و دعم المرضى .
التدريس عالى الجودة للطلاب الجامعيين بكليات الطب البشرى و الأسنان والتمريض و كذلك التدريس لطلبة الدراسات العليا فى جميع فروع الطب وطب الأسنان و دبلوم العلوم البيولوجية واجراء البحوث العلمية الهامة القابلة للتطبيق و معالجة المشاكل المجتمعية ذات الصلة بالعدوى والمناعة بهدف التشخيص الدقيق والسيطرة على الامراض المعدية .